Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRKAB2O43741 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKAB2O43741 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKAB2O43741 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRKAB2O43741 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms