Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT1O43278 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPINT1O43278 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPINT1O43278 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms