Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRXO43186 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRXO43186 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRXO43186 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRXO43186 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRXO43186 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRXO43186 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRXO43186 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRXO43186 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRXO43186 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRXO43186 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRXO43186 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRXO43186 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRXO43186 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRXO43186 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRXO43186 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRXO43186 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CRXO43186 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRXO43186 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRXO43186 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRXO43186 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRXO43186 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRXO43186 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRXO43186 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms