Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRP8O43159 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP8O43159 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP8O43159 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP8O43159 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRP8O43159 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP8O43159 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP8O43159 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP8O43159 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP8O43159 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP8O43159 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP8O43159 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP8O43159 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRP8O43159 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRP8O43159 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RRP8O43159 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP8O43159 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP8O43159 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP8O43159 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP8O43159 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP8O43159 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRP8O43159 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP8O43159 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP8O43159 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP8O43159 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP8O43159 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP8O43159 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP8O43159 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP8O43159 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RRP8O43159 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP8O43159 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP8O43159 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP8O43159 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP8O43159 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP8O43159 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRP8O43159 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP8O43159 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP8O43159 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP8O43159 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP8O43159 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP8O43159 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP8O43159 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP8O43159 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRP8O43159 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP8O43159 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP8O43159 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP8O43159 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP8O43159 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP8O43159 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP8O43159 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP8O43159 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP8O43159 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP8O43159 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRP8O43159 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP8O43159 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP8O43159 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP8O43159 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP8O43159 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP8O43159 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP8O43159 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP8O43159 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRP8O43159 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRP8O43159 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRP8O43159 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRP8O43159 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRP8O43159 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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