Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IKBKBO14920 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IKBKBO14920 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms