Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR6O00574 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR6O00574 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR6O00574 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR6O00574 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR6O00574 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR6O00574 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR6O00574 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR6O00574 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCR6O00574 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR6O00574 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR6O00574 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCR6O00574 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR6O00574 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCR6O00574 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR6O00574 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR6O00574 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR6O00574 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR6O00574 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR6O00574 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR6O00574 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR6O00574 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR6O00574 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR6O00574 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR6O00574 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CXCR6O00574 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR6O00574 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR6O00574 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR6O00574 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR6O00574 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR6O00574 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR6O00574 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR6O00574 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR6O00574 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR6O00574 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms