Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3B1O00203 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3B1O00203 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms