Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAPO00193 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAPO00193 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAPO00193 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAPO00193 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAPO00193 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAPO00193 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAPO00193 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAPO00193 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAPO00193 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAPO00193 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAPO00193 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAPO00193 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAPO00193 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAPO00193 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAPO00193 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAPO00193 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAPO00193 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAPO00193 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAPO00193 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAPO00193 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAPO00193 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAPO00193 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAPO00193 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAPO00193 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAPO00193 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAPO00193 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAPO00193 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAPO00193 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAPO00193 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAPO00193 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAPO00193 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAPO00193 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAPO00193 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAPO00193 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAPO00193 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAPO00193 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAPO00193 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAPO00193 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAPO00193 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAPO00193 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAPO00193 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAPO00193 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAPO00193 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAPO00193 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAPO00193 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAPO00193 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAPO00193 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAPO00193 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAPO00193 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAPO00193 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAPO00193 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAPO00193 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAPO00193 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAPO00193 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAPO00193 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAPO00193 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAPO00193 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAPO00193 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAPO00193 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAPO00193 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAPO00193 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAPO00193 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAPO00193 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAPO00193 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAPO00193 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAPO00193 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms