Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TK2O00142 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TK2O00142 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TK2O00142 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TK2O00142 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TK2O00142 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TK2O00142 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TK2O00142 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TK2O00142 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TK2O00142 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TK2O00142 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TK2O00142 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TK2O00142 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TK2O00142 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TK2O00142 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TK2O00142 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TK2O00142 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TK2O00142 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TK2O00142 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TK2O00142 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TK2O00142 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TK2O00142 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TK2O00142 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TK2O00142 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TK2O00142 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TK2O00142 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TK2O00142 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TK2O00142 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TK2O00142 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TK2O00142 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TK2O00142 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TK2O00142 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TK2O00142 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TK2O00142 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TK2O00142 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK2O00142 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK2O00142 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK2O00142 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK2O00142 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK2O00142 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK2O00142 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK2O00142 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK2O00142 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TK2O00142 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TK2O00142 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TK2O00142 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TK2O00142 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TK2O00142 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TK2O00142 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TK2O00142 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TK2O00142 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TK2O00142 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TK2O00142 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TK2O00142 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TK2O00142 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TK2O00142 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TK2O00142 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TK2O00142 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TK2O00142 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TK2O00142 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TK2O00142 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms