Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PABPN1LA6NDY0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PABPN1LA6NDY0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PABPN1LA6NDY0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms