Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC13A5PLN9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC13A5PLN9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms