Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A4D1N5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4D1N5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4D1N5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4D1N5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4D1N5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A4D1N5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
A4D1N5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A4D1N5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4D1N5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4D1N5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4D1N5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4D1N5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4D1N5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4D1N5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4D1N5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4D1N5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4D1N5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4D1N5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A4D1N5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A4D1N5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms