Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf170A2RU37 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf170A2RU37 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C9orf170A2RU37 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms