Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCRBV7S3A2A0A539 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
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TCRBV7S3A2A0A539 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
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TCRBV7S3A2A0A539 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCRBV7S3A2A0A539 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV7S3A2A0A539 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV7S3A2A0A539 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV7S3A2A0A539 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV7S3A2A0A539 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV7S3A2A0A539 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV7S3A2A0A539 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCRBV7S3A2A0A539 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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