Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1B0GVM2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GVM2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GVM2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms