Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A0D9SFI3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A0D9SFI3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A0D9SFI3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms