Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHKBQ9Y259 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms