Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms