Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERVK-18Q9QC07 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms