Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHPF2Q9P2E5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms