Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCGF6Q9BYE7 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms