Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRTQ9BXP5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms