Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LPIN3Q9BQK8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LPIN3Q9BQK8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms