Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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HDAC11Q96DB2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HDAC11Q96DB2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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