Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRRN4Q8WUT4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRN4Q8WUT4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms