Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR44Q5JSH3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms