Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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