Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CA9Q16790 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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CA9Q16790 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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CA9Q16790 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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CA9Q16790 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CA9Q16790 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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CA9Q16790 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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