Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CLPPQ16740 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CLPPQ16740 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms