Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TAF1AQ15573 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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