Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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