Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FPGSQ05932 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms