Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms