Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IRX4P78413 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IRX4P78413 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IRX4P78413 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms