Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCA4P51532 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms