Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXC13P31276 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms