Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEFHP12036 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEFHP12036 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEFHP12036 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms