Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LTAP01374 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LTAP01374 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LTAP01374 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LTAP01374 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LTAP01374 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LTAP01374 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LTAP01374 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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LTAP01374 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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LTAP01374 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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LTAP01374 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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LTAP01374 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LTAP01374 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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