Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMAD6O43541 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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