Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms