Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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COPS3Q9UNS2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS3Q9UNS2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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