Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNRF3Q9ULT6 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms