Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC23Q9UJX2 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDC23Q9UJX2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms