Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM55Q9BYV6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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