Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SAMD8Q96LT4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms