Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRIQ1Q96JM4 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.5 ms