Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC107Q8WV48 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms