Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD1Q8NHV4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD1Q8NHV4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms