Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms