Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMNTD2Q8IXW0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms